今回の大会から都心部の区間が都島通を経由する新コースへ切り替わった影響により、これまで一部区間迂回で運行されていた36号系統(大阪駅前〜地下鉄門真南)が新たに全区間運休となったほか、37号系統(井高野車庫前〜大阪駅前)･83号系統(大阪駅前〜花博記念公園北口)でも大阪駅前方面行きのみ新たに迂回運行が発生した。

■「第12回大阪マラソン」に伴う運休･迂回運行(シティバス分のみ)
・日時…2月26日 700〜1700ごろ
・影響系統(全区間運休)…8号･12号･18号･29号･35号･35A号･36号･46号･48号･55号･60号･62号･73号･75号･85号･21号･22号･52号
・影響系統(一部区間運休)…10号･31号･70号･71号･76号･87号･90号･91号･98号･19号･51号･84号･94号
・影響系統(行先変更)…241号
・影響系統(一部区間迂回)…240号･37号･46号*･53号･80号･83号･88号
*京阪東口〜東野田間の規制解除後