通勤バスは夢洲への通勤車両乗り入れを減らす目的で工事が行われる平日と一部の祝日に設定されたもので、運行開始時直後はシティバスに加えて西日本JRバスや日本交通の3社で貸切扱いの共同運行を行い、その後は西Jバス･日交の撤退や舞洲発着便の廃止を経て一般路線扱いの運行へと移行。

シティバス便は運行開始直後から一貫して酉島営業所が担当しており、使用車両は一般路線用だった元･大阪市交の移籍車の暫定投入ののち本番の来場者輸送にも使用される電気バスへ順次置き換えを行い、通勤バス用の電気バスは前面にオオサカメトロのロゴが取り付けるなど、一般路線向けの車両と異なる仕様で導入されている。

通勤バスの運行は2025年1月に予定されているメトロ中央線の夢洲延伸まで続けられる見込みで、工事の進捗状況に合わせて運行ダイヤは1ヶ月おきに変更される体制が取られている。