ご訪問当日の6日は会場内で厳重な警備体制が敷かれたことから、両陛下がご訪問された11時15分ごろから19時ごろにかけてイームーバーの運行を取り止め、東ゲート前から西ゲート前へ向かうイームーバーの東西輸送も始発･終車ともに15分ずつ繰り上げとなった。

また、一般路線の81号系統(西九条〜舞洲スポーツアイランド)で両陛下のご到着･ご出発に合わせて運行が取り止めとなったほか、メトログループが運行に関連する桜島駅万博シャトルバスや舞洲パークアンドライドシャトルバスでも、両陛下のご到着･ご出発前後の時間帯を対象に運行間隔や所要時間変更の対応がとられた。

■天皇皇后両陛下万博会場行幸啓に伴う運行計画変更(一般路線分)
・日時…10月6日 955ごろ〜1230ごろ･1655ごろ〜1920ごろ
・対象路線(全区間取りやめ)…81号